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服务名称

服务内容

服务期限

1

人全血样本转录组检测项目

完成369个人total RNA转录组信息采集，采用DNBSEQ平台，PE150测序策略，目标采集数据量为20G clean data，在总数据量达标的情况下，承诺单个样本采集数据量不低于目标数据量的90%，如有信息分析，则完成相应的信息分析。信息分析内容：标准信息分析：1、基本数据统计①、去除接头序列、低质量序列得到 reads 信息，②、样品相关性，③、表达量分布，④ RNA分类；

2、参考基因组比对；

3、mRNA 鉴定；

4、mRNA 定量分析；

5、mRNA 差异表达分析（样本间、组间）；

6、mRNA表达/差异基因聚类；

7、mRNA差异基因GO分类、富集；

8、mRNA差异基因KEGG分类、富集；

9、mRNA结构分析：可变剪切分析，

10、mRNA结构分析：融合基因分析（仅限人）

eQTL主要的分析

1、转录组测序及下机数据质控

2、比对和基因表达量计算

3、表达量质控与处理

4、协变量引入和计算：Structure+Kinship+Sex+Age+…

5、变异质控

6、eQTL分析

7、顺式和反式eQTL识别

8、eQTL区域loci注释和富集

9、差异eQTL分析：治疗特异性的动态eQTL

10、共表达分析

11、调控网络分析

12、结合GWAS协同分析

13、连锁单倍型分析

验收合格之日起 1年